Els probiòtics més utilitzats són els que pertanyen a bactèries del gènere Lactobacillus i Bifidobacterium.
Cal tenir present que hi ha aliments com el iogurt i el quefir que es composen de probiòtics, però que contenen baixes dosis.
En resum, els probiòtics haurien de ser utilitzats sempre davant d’un tractament amb antibiòtic, però també poden utilitzar-se per ajudar a tractar diferents alteracions intestinals com ara la síndrome del colon irritable, distensió abdominal, diarrea, flatulències, estrenyiment o candidiasi.